東洋文庫ミュージアムは、東洋文庫の歴史や文化を展示する施設です。現在は「知の大冒険ー東洋文庫 名品の煌めきー」や「東南アジア～交易と交流の海～」などの展示や、日本語の歴史や医学系洋古書の展示、シーボルト資料や伊能図の展示などの講演会やイベントが開催されています。